重测序项目对目标样本的基因组DNA进行建库和测序，然后通过生物信息学分析将测序数据比对到参照基因组上，从而得到大量的遗传变异信息。常见的应用方向是GWAS、突变微点定位、遗传进化等。

2014Xu,Identification of candidate genes for drought tokerance by whole genome resequencing in maize

与芯片KASP等标记检测方法相比，重测序项目有两个主要区别：

一、重测序可以检测出目标样本中所有可测到的遗传变异,其中很多可能是全新的变导位点, 但是芯片和KASP等技术只能检测已经设计好并且验证过的变导位点。

二、重测序可以发现大量的遗传变异位点，一般来说芯片能够达到几万到几十万的标记密度，但是重测序一般可以产生百万以上级别的标记密度。

所以对于标记密度要求很高或者群体多态性特殊的项目来讲，重测序是一个很好的选择。

中玉金标记从收到样本到完成客户所需的分析一般需要 30 天到 60 天不等，如果客户需要订制化服务则可能需要更长的时间。

    韩斌院士研究组对517个大米地方种进行重测序得到了大约360成个SNP标记，并利用SNP标记对14个农艺性状进行了全基因组关联分析（GWAS）。

    技术路线总结：

    1．收集大量高多态性材料组成自然群体;

    2．对自然群体进行重测序;

    3．通过生物信息学分析得到大量SNP标记;

    4．SNP标记功能注释、Imputation、群体结构分析;

    5．进行GWAS分析，得到每个性状相关联的QTL;