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SNP 基因型检测- 小麦90K 芯片检测

Wheat90K芯片由illumina公司与E. Akhunov(KSU)、M. Hayden (DPI Victoria,Australia)以及C. Cavanagh(CSIRO,Australia)等多家机构合作完成的联盟芯片,包含美国澳大利亚合作项目中的50,000个SNP位点、英国SNP项目的12,000个SNP位点、美国NSF小麦SNP项目的800个SNP位点、法国科学家提供的保守同源基因的5,000个SNP位点、意大利科学家提供的T. durum中的2,000~3,000个SNP位点、美国科学家提供的Aegilops tauschii中的5,000个SNP位点、澳大利亚科学家提供的1,000个第7染色体的SNP位点以及1,000个TraitGenetics GmbH提供的SNP位点等。


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24制式的芯片图片(小麦90K是24制式芯片)

技术特点

小麦90K芯片的特点如下:

1、位点数/样本:81,587

2、芯片规格:24样本/芯片

3、数据检出率:97%

4、81,587 个SNP中,46,977 个SNP在小麦的 21 条染色体上有遗传学或物理图谱的映射(见下表)


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技术流程

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项目周期

由于芯片是 24 制式的,需要满足 24样品 才能起始实验,中玉金标记从收到样本到完成客户所需的分析需要一个月左右,如果客户需要定制化服务则可能需要更长的时间。

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