小麦 55K 芯片是由中国农科院作物科学研究所小麦基因组与基因资源研究团队在小麦 660K（W660）SNP芯片的基础上开发的一款经济型中密度SNP芯片。芯片共 55000 个左右的小麦SNP标记，均匀分布在 21 条染色体上，每条染色体上平均有 2600 个左右，标记间的平均遗传距离约为 0.1cM ,平均物理距离小于 300Kb。

1. 有效标记数量最多

小麦55K芯片最大限度的发挥了Affymetrix公司中密度芯片的优势(最多55000)，同时标记都是从W660中精选出来的，经过了数千份材料的检验，实现了多倍体、二倍体化。因此芯片不仅标记数较多，而且有效标记的比例高，是目前世界上同类芯片中有效标记数最多的一款芯片；

2. 应用价值更高

由于标记数量多，分布较均匀，标记间的平均遗传距离仅为0.1cM，因此标记与绝大部分目标性状基因紧密连锁或共分离，具有更高的利用价值。

3. 标记的信息最丰富

小麦55K芯片为我国自己独立开发的有我国完全自主知识产权的小麦芯片，具有完整而详细的基因组信息（标记在小麦基因组中的位置，序列信息等），用户可免费使用这些信息，方便咨询，有利于开展进一步深入研究；

4. 性价比最高

这款芯片与国外同类芯片相比，价位基本相同，但有效标记数大约是国外芯片的2倍，因此性价比最高。

5. 小麦55K芯片参数

       1、位点数：55000个；2、有效标记比例：97%以上；3、多态性标记比例：95%以上；4、基因组分布：均匀分布，平均每条染色体上约2600个标记，标记间的遗传距离约为0.1cM，物理距离约为270K。

6. 小麦55K芯片与小麦35K芯片的比较

1、有效标记数约为35K的2倍；2、较35K的基因组分布均匀；3、标记的基因组位置与基因组信息明确。

      小麦55K芯片是一款中密度SNP芯片，适合于一般的种质资源多样性分析、一般的遗传作图与新基因发掘、一般的比较基因组分析、品种注册与鉴别（指纹分析）。由于标记与绝大部分重要农艺性状基因紧密连锁或共分离,同时与高密度芯片相比，其价位较低，同时更适合于分子育种。

      1. 种质资源多样性分析；

      2. 遗传作图与新基因发掘；

      3. 比较基因组分析；

      4. 品种注册与鉴别（指纹分析）；

由于芯片是384制式的，需要满384样品才能起始实验，中玉金标记从收到样本到完成客户所需的分析需要一个月左右，如果客户需要定制化服务则可能需要更长的时间。

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