Successful case
科研解决方案
玉米(Zea mays)10K育种芯片包含 9,433 SNP标记,其中 1,206 为功能标记,8,227 为基因组覆盖标记。
芯片设计要点如下:
1、标记质量高、稳定性高
2、标记均匀覆盖基因组
3、标记多态性高
4、包含抗丝黑穗病、抗茎腐病、抗南方锈病、穗轴色、抗旱等功能标记
5、覆盖热带种质多态性
对玉米自交系材料进行玉米10K育种芯片检测,然后进行以下分析:
1、判断材料的杂种优势群归属
2、拆分材料中不同血缘所占比例
3、计算所有材料间的遗传相似度
4、计算每份材料与玉米骨干自交系的遗传相似度
5、通过功能标记对每份材料的丝黑穗病抗性、茎腐病抗性等性状进行预测
6、通过功能标记将优良农艺性状导入现有自交系,同时通过背景标记确保原有农艺性状不变
7、结合表型数据进行基因定位
8、结合表型数据进行表型预测
9、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析
10、得到高密度品种指纹图谱,可以结合对照样本进行品种真实性分析
1、广东省农业科学院
2、华中农业大学
3、中国农业科学院作物科学研究所
4、中国农业大学
电话:13910342709 15313080697
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