水稻（Oryza sativa）8K育种芯片包含 7,519 SNP标记，其中 1,102 为功能标记，6,417 为基因组覆盖标记。

芯片设计要点如下：

1、标记质量高、稳定性高；

2、标记均匀覆盖基因组；

3、标记多态性高；

4、覆盖100多个与水稻重要农艺性状相关联的功能基因；

5、包含籼粳分化SNP标记；

6、包含中花11水稻单株重测序差异最大SNP标记；

对水稻材料进行水稻8K育种芯片检测，然后可以进行以下分析:

1、通过功能标记对每份材料的主要农艺性状进行预测；

2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料，同时通过背景标记确保原有农艺性状不变；

3、将所有材料进行划群分析；

4、计算所有材料间的遗传相似度；

5、结合表型数据进行基因定位；

6、结合表型数据进行表型预测；

7、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析；

8、得到高密度品种指纹图谱，可以结合对照样本进行品种真实性分析；

1、华中农业大学

2、中国水稻研究所

3、中国科学院植物研究所

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