重庆市农业科学院果蔬所

合作单位：重庆市农业科学院果蔬所 & 中玉金标记（北京）生物技术股份有限公司

项目介绍：

重庆是全国柠檬核心主产区，以潼南为核心形成规模化柠檬产业布局，重庆市农业科学院柠檬及特色果树创新团队长期深耕柠檬种质资源收集、抗病新品种选育、黄脉病防控、优新品种改良工作，已培育出金柠 1 号等高抗黄脉病突破性柠檬新品种，储备大量杂交后代、地方种质、引进资源，是国内柠檬种质创新核心科研单位重庆市人民政府网。

当前柠檬育种存在显著产业痛点：传统表型选育周期漫长，柠檬童期长、性状鉴定耗时长；种质亲缘关系模糊，同名异物、同物异名乱象普遍；黄脉病抗性、果实出汁率、无籽、品质等关键性状早期筛选效率低；缺少适配川渝本地柠檬种质的高密度分型工具，品种真实性溯源、实质性派生品种判定缺乏高通量分子支撑，制约柠檬分子设计育种产业化提速。

中玉金标记与重庆市农业科学院果树研究所深度合作，基于高深度重测序数据，联合开发柠檬 50K基因芯片，与现有的重测序技术相比，柠檬50K基因芯片克服了重测序数据量大、无用信息多、分析难度大等缺陷，实现快速检测、降低成本、数据分析简单等有利于产业发展的优势；与简化基因组测序(GBS)相比，柠檬50K基因芯片避免了GBS分析时存在的数据重复性差，以及不同材料、实验室和平台之间所获得的GBS标记数据很难进行比对和累加，从而致使GBS数据难以在大规模群体中利用缺陷；柠檬50K基因芯片具有数据结果一致率高、同一材料数据可长期使用且数据分析相对简单等诸多优势。

总体来说，柠檬50K基因芯片，可有效应用于柠檬遗传多样性分析、分子遗传图谱构建、全基因组关联分析、品种真实性鉴定、分子标记辅助选择育种、全基因组选择育种。