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中玉金标记KASP基因分型平台体系介绍

2025,03,19
来源:中玉金标记
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KASP 即竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR),可在广泛的基因组DNA 样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA 样品),对SNPs 和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。


KASP 技术由于其高通量、低成本和检测效率高等优点而在农作物性状遗传和改良研究领域备受关注,现已在全球广泛应用。


其应用领域包括

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 中玉金标记KASP平台优势 


目前,中玉金标记KASP基因分型平台已累计检测超过了3000多万数据点,样本类型涵盖植物、动物、人类及海洋生物。


1.价格低:每个标记检测价格只需 1 元人民币,样本量大可低于 1 元人民币。


2.高效的实验流程:从样本接收到 DNA 提取、质检、上机检测,再到下机数据交付,整个流程高效快捷,只需要 5 天左右的时间。相比一些传统的基因分型技术,如测序法等,其检测周期大大缩短,能够快速为研究者提供基因分型结果,加快研究进程。


3.高通量检测能力:可以同时对大量样本进行检测,提高了检测效率,在短时间内能够完成大规模样本的基因分型工作,进一步缩短了整体的检测周期。


4.样本适用性广:样本类型涵盖植物、动物、人类及海洋生物等,对各种复杂样本具有良好的适应性,能够满足不同研究领域和应用场景的需求。


 中玉金标记KASP平台特点 


1.KASP试剂是为经过优化的PCR试剂,位点特异性扩增强,标记转化率高,可达到90%以上;


2.KASP基于荧光分型的,结合微量反应的LGC SNPline和Douglas Scientific Array Tape全自动基因分型平台,检测快速、准确、成本低;


3.每个PCR可灵活调整,一个批次可检测样品数从数十个到数万个,标记数从数个到数百个;


4.KASP平台可结合标记/DNA储存管理系统STT3K0、LCG Kraken管理系统、Douglas Scientific Intellics管理系统以及StarLIMS实验室信息管理系统,从样品提交到基因分型,全流程自动化数据跟踪,数据出错概率小,追溯性强;


5.拥有专门的标记开发、基因组DNA提取及质检、SNP检测、数据分析等团队,每个步骤都有标准化的操作流程及相应的质检方案,样品检测准确、重复性强。


 中玉金标记KASP检测设备 


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 我们利用KASP技术自主开发出了一批高质量SNP标记 


物种包括了玉米、小麦、水稻、大豆及多种蔬菜作物的全基因组标记,这是分子育种的基础并结合遗传分析及群体结构分析,目前已有众多客户在使用。


1、 玉米抗病标记:75个

2、 玉米各种农艺性状标记:950个

3、 小麦抗赤霉病标记:8个

4、 小麦各种农艺性状标记:1260个

5、 水稻各种农艺性状标记:1102个

6、 大豆生育期等标记:270个

7、 油菜抗病、品质标记:15个


  中玉金标记KASP平台下机数据  


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  参考文献  

1. KassaSemagn et al. (2013) Single nucleotide polymorphism genotyping using Kompetitive Allele Specifi c PCR (KaSp): overview of the technology and its application in crop improvement. Molecular Breeding.