大豆（Glycine max）5K育种芯片包含 4,599 SNP标记，其中 270 为功能标记，4,329 为基因组覆盖标记。

芯片设计要点如下：

1、标记质量高、稳定性高；

2、标记均匀覆盖基因组；

3、标记多态性高；

4、包含开花期、生育期功能标记；

对大豆材料进行大豆5K育种芯片检测，然后可以进行以下分析：

1、通过功能标记对每份材料的开花期等性状进行预测；

2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料，同时通过背景标记确保原有农艺性状不变；

3、将所有材料进行划群分析；

4、计算所有材料间的遗传相似度；

5、结合表型数据进行基因定位；

6、结合表型数据进行表型预测；

7、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析；

8、得到高密度品种指纹图谱，可以结合对照样本进行品种真实性分析；

1、中国科学院东北地理与农业生态研究所

2、中国农业科学院作物科学研究所

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