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概述
AGROBASE Generation II® 是基于全面关系型数据库的试验研究和植物育种综合管理软件系统。统一的视窗界面便于学习和使用。该软件从基本系统的许可开始,客户可根据需要增加模块。基本系统和每个模块每年都会增强,未来还会开发新的模块。所有基本系统的特征和功能都在试验模块中。本文档是软件模块的概述。欲了解更多,请参考帮助手册中相应模块的内容。
试验模块
该模块是AGROBASE Generation II®的基础,它提供了进行农艺和育种测试需要的所有功能和特性。该模块中的工具可分为如下四类:
项目组
可以把不同的作物种类或者试验类别的数据按项目组存储。项目组具有如下的特性和功能:
1,密码安全机制阻止访问项目组数据;
2,管理项目组数据库;
定义参数:设置项目组
1, 存储处理、性状(分析变量)和地点名称以及项目组(数据库)的静态信息;
2, 对分析变量/性状、处理、地点或者试验名称的更改可迅速传导到整个项目组;
3, 根据性状或者多性状组合的指数来选择处理;
4, 按一定逻辑对处理、对照、测试、地点和性状进行分组,以便高效生成多点测试;
5, 管理处理、地点和性状的说明文字;
设计试验
完成如下试验设计:完全随机区组、方形和长方形格子设计、裂区、再裂区、条区、析因设计、拉丁方、拉丁长方以及平衡分组或者不平衡区组试验设计。
1, 管理每个试验的说明信息;
2, 一次完成单点或多点试验的设计;
3, 田间管理工具:田间种植图、标签和报告;
4, 交互式标签和报告生成器可以直观设计多种类型标签、报告或者记载本;
5, 支持Code 39 式、Code 25 式和Code 128 式等多类条码;
6, 直观的田间种植图,适合单方向或者折返式的种植顺序、小区用行列来指定;
7, 产生播种顺序计划和收获顺序码;
8, 收获顺序:按播种顺序,从前到后、折返形、收缩折返、单向式/折返式顺序收获。
9, 数据分析和决策支持工具:数据探究、整理和分析
10, 从试验和测试、处理、性状、地点和年份等出发,真正关系型研究数据管理;
11, 利用研究数据管理器通过“指向-点击”方式直接访问数据;
12, 添加和去除试验中性状;
13, 交互的电子表格式数据录入和编辑;
可以导入多种格式的数据,包括Excel®, FoxPro®, EDE®, dBase®, Lotus 1-2-3®, Paradox®,Symphony®, Multiplan®, ASCII 文本和RapidFile® 等;
以多种格式导出数据,包括Excel®, FoxPro®, ASCII 文本, DIF, Lotus 1-2-3®, Symphony®,Multiplan®以及系统数据格式;
14, 把据记录器或者其它格式数据导入试验;
15, 编辑、排序、修改或追加外部的dBase® 或FoxPro 兼容格式的数据文件;
16, 加入用户定义的公式或者计算字段进行特定的数据转换;
17, 通过描述统计、频数分布和直方图来探究数据;
18, 进行成对或独立的组进行t 检验;
对如下设计进行方差分析:完全随机区组、方形或条方格子设计、裂区、再裂区、条区、因子试验、拉丁方、拉丁长方和组平衡区组试验设计等;
1, 一次分析多个试验或者测试(多重的单方差分析)
2, 通过移动平均分析来处理无重复或者带状测试;
3, 移动数据采集(平板模块)
(1)帮助用户进行田间数据采集并且无缝整合田间数据与电脑数据;
(2)单次可上传36 万个数据点,最多包括2 万个小区的6 个字符型性状、6 个数字型性状、3 个逻辑型性状和3 个日期型性状;
(3)通过性状列表定义来简化数字或者字符型数据的田间录入;
(4)通过日历样式来录入日期型数据;
(5)通过复选框来输入逻辑型数据:选中为是,不选为否;
4, 当通过种植图方式上载时,有3 中导航方式:
(1)利用拇指板从一个小区进入到附件任何一个试验小区;
(2)利用屏幕上的箭头来向上或者向下移动一个记录;
(3)键入小区号然后搜索进入;
AGROBASE Generation II®其它模块
试验模块之外,本软件还有育种、高级统计、品种比较、图像显示和种子库存等模块。
一, 育种模块
1,该模块支持多种作物、多种育种模式的系谱数据管理,并与试验模块通过关系链接。
2,参数定义:亲本
(1)录入新亲本、从新系创建亲本、或者从试验处理导入亲本;
(2)创建亲本系谱的详细报告;
3,设计工具:杂交计划
(1)利用亲本、处理或育种圃中的材料创建杂交;
(2)杂交可以是一对一、多对一或者多对多;
(3)双列/相互杂交;
(4)亲本组中顺序杂交;
4,设计工具:育种圃设计
(1)产生杂交圃;
(2)产生F1 到Fn 的育种圃;
5,分离:
(1)单系或者多个单系;
(2)混合行/系;
(3)进行姊妹交;
(4)产生双单倍体;
(5)压缩育种圃、去掉没淘汰的系;
(6)做杂交:在育种圃中完成组配
二,高级统计
1, 该模块可对更多高级的试验设计进行随机化和分析,包括产量测试的空间分析、多元分析和其它高级统计分析。
2, 设计和分析Alpha(0,1)、通用格子设计和优化的增广2 型设计;
3, 设计和分析近邻设计:该设计在品种测试利用临近的残差或次要差异模型来剔除杂乱的土壤变异趋势,从而确定最可能的品种顺序;
4, 利用含固定效应的一般线性模型来分析不平衡或者缺失数据或更复杂试验的试验设计,包括试验间、地点间和年份间品种不一致的情况;
5, 设计和分析双列试验,可进行四种模式(涉及亲本、F1 和反交)的Griffing 分析;
6, 设计和分析测交试验;
7, Hotelling 多元t 检验;
8, 主成分分析;相关分析、最大似然分析、卡方检验;生物化验数据的概率分析;
三,品种比较
1,这个模块在一次测试中、或跨越所有测试、所有地点、多有年份来比较品种的相对表现,并分析基因型环境互作。
2,基因型环境互作分析方法:基于互作平方和划分的生态价方法,稳定性方差,整合相对表现和稳定性的品种优势度,Eberhart Russel 回归,和Nassar-Huehns 秩次检验;AMMI分析,输出两向图;
3,进行可视化品种表现栅格分析,鉴定品种超过对照、试验均值或特定品种的百分数;
4,可针对任意两个品种或任意品种对比一组品种,利用任意或所有试验、年份、地点、或者选定的数据,进行头对头比较。这是利用系统的产量试验来评估选择响应或者推广品种。
5,创建自定义的多性状选择指数,包含截断选择和权重指数;
6,通过多年总结可以汇总多达20 年的品种表现;对于常见的年份间品种更迭导致的不平衡数据,系统会重新计算可以平衡对比的年份或者地点数据的滚动平均、新的LSD、新的CV;
7,查询或者搜集任意组品种或基因型在任意年、任意地点、任意试验或任意育种圃的数据;
8,从任意年份、地点、试验或者育种圃中根据一个或者多个性状指标来查询或者搜集品种或基因型。这一强大工具,可以鉴定出适合做亲本或作为新品种上市的基因型。
四,图像显示
1,这一模块可以连接任意Windows 支持的扫描仪直接扫描图片。图片可以连接到品种或者处理名称。
2, 支持的图片格式:MP, JPG, TGA, TIF, PCX, EPS, WMF;
3, 可在连接的图片间快速移动;
4, 为连接的图片保存说明;
5, 在25-200%之间缩放图片;
6, 按固定或者用户定义的角度旋转图片;
7, 选择图片的一部分并剪裁;
8, 颠倒和翻转图片;
9, 黑白或者彩色打印图片;
10,直接扫描图片存入数据库;
11,可以按小区为基础存储图片;
12,在小区列用颜色显示是否附有图片(绿色=有,红色-没有);
五,种子库存
1,该模块可以创建和管理处理、亲本和群体的种子批。一个种子批是任意可计量数量的种子。本模块的工具可用来创建、管理和跟踪种子批的数量、地点和流转历史。种子模块可划分为四个组成部分:
2,种子批:存储待用的与品种关联的任意数量种子;
3,种子批存储地点:种子批存储实际位置的名称;
4,种子批单位:种子库存管理过程中被各功能使用的种子数量计量单位;
5,种子批流转:任意或者所有种子批出入库的历史记录。