本研究结合激光显微切割（LCM）和转录组测序，对玉米籽粒各细胞类群（compartments）进行了全基因组水平表达分析，对胚乳相关细胞类群的基因表达调控特征进了系统分析。结果表明，籽粒中母本类群（maternalcompartments）和子代类群（filial comparments）表现出不同的基因表达模式，足以在mRNA 水平区分不同遗传来源的细胞类群。 进而，通过基因共表达网络重构，鉴定了与胚乳细胞类群相关的表达调控模块（module），其中有些模块富集了以前研究中已确定的在胚乳分化过程中暂时激活的基因及印记基因（imprinted gene）。通过与基底胚乳转移层（BETL）高度相关的共表达模块的功能分析，鉴定了被胚乳发分化调控因子MRP-1 激活的表达调控模块。

本研究为玉米籽粒分化提供了高分辨率的表达谱数据，并有助于揭示胚乳分化过程中重要表达调控模块。